La filière agro-alimentaire de la transformation agricole génère des sous produits organiques très divers : lactosérum, pulpes de betteraves, vinasses, déchets de légumes en conserverie, fruits et légumes de retrait, déchets d’abattage (peaux, plumes, duvets).

En Provence-Alpes-Côte-d'Azur le gisement, principalement constitué des déchets des conserveries et distilleries, est évalué à 97 000 t par an.

Leur composition (présence d'éléments nutritifs ou fertilisants) leur confère souvent une valeur pour l'alimentation animale ou pour l'amendement des sols, dans la mesure où ils ne contiennent pas d'éléments toxiques à des teneurs présentant un risque pour la santé.

Pour les détenteurs de tels déchets, il est tout d'abord nécessaire de consulter les administrations de tutelle en matière d'agriculture, d'industrie et d'environnement ou des organismes spécialisés, afin de caractériser le déchet pour déterminer s'il est valorisable et obtenir les autorisations réglementaires. Ensuite l'industriel pourra s'équiper lui-même pour traiter ces déchets ou décider de sous-traiter à un prestataire de service.